電影: Ryo Horikawa

邪惡組織紅領巾軍曾被悟空消滅，承繼了那股邪惡意志的人們創造了終極最強人造人 — 伽瑪1號和2號。他們自稱為「超級英雄」 （SUPER HERO），更開始對笛子魔童及悟飯施以襲擊！到底這班捲土重來的新生紅領巾軍目的是什麼？危機逐漸逼近，是時候覺醒了 — 真正的「超級英雄」！...

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斧江財團位於北海道函館的收藏庫，收到了來自怪盜基德的預告信。 基德這次的目標，是與幕末的新選組副長．土方歲三有關的日本刀。尋求大寶石的基德，為何會盯上刀……？另一方面，關西的名偵探．服部平次與柯南等人，也為了在函館舉辦的劍道大賽而造訪當地，預告犯罪日當天，平次成功識破基德的偽裝，並將他逼入絕境，然而……！？ 同一時間，在函館倉庫街上發現一具胸前有十字刀痕的遺體。在調查過程中浮出水面的，是在亞洲一帶以軍火商身分行動，被稱為「死亡商人」的日裔美籍男子。 他在尋找戰時與軍需產業有密切關係，斧江家第一...

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鈴木園子的叔叔次郎吉不甘心失敗，決定再次向怪盜基德發出挑戰。這位壞脾氣的大叔斥巨資製造了巨型的飛船貝爾·雪利二世號，並以鑲嵌有名貴寶石「天空的貴婦人」的戒指作賭注，邀請基德前來挑戰，看他能否在東京到大阪的這6小時時間內完成這項困難的任務。柯南、小蘭等人理所當然也接到邀請，甚至電視台的人也興師動眾前來。隨着時間的流逝，雙方的對決悄悄展開。另一方面，恐怖組織紅暹羅貓也登上了飛船。此前不久，紅色暹羅貓襲擊了國立東京微生物研究所，並盜走一種致命的病毒。...

怪盜基德再度發出預告信，目標是俄羅斯羅曼諾夫王朝的皇室祕寶「記憶彩蛋」。柯南與服部聯合保護「記憶彩蛋」，因毛利小五郎將作案時間推理錯誤使基德得逞，但基德於逃走中途被不明人物狙擊。自此引出一連串疑問，柯南將解開一連串事件。...

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大阪 京都，正在錄製"皐月杯"百人一首記者會的大阪地標·日賣電視台突然發生爆炸，千鈞一髮之際，急忙趕來的柯南救出了被困在崩塌大樓中的平次與和葉，而另一側，"皐月杯"冠軍在京都屋內遭人殺害，監控器裡所顯示出的是——紅葉...原作中的重要角色，百人一首高中生冠軍，自稱"平次未婚妻"的大岡紅葉，將首次在劇場版中登場，新一和小蘭的關係也將發生變化......

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東京、大阪和京都發生殺人事件，三個城市的警方調查後，發現事件中的死者都是盜賊團「源氏螢」的成員，毎人都有一個代名，以《義經》內的傳統人物命名。同時間，小五郎應京都寺院的邀請，前往京都調查寺內八年前藥師如來佛像盜竊事件。寺院早前得到佛像下落的線索，是一件有不同圖案的圖畫，提供給小五郎，以便儘快尋回佛像。 服部亦因殺人案，前往京都調查事件的真相。期間遇上柯南，兩人一起調查兩宗事件，發現兩宗事件都有共同點，有助解開八年前佛像盜竊事件。在調查期間亦發生殺人案，服部因此而受襲，和葉亦因查找施襲者線索而被...

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柯南、小蘭、毛利小五郎以及少年偵探團等人，一同參加了神盾艦的體驗航海活動，在日本海上自衛隊員的示範下，親眼見識到氣勢非凡的空中對戰演習。這時候，神祕的敵軍突然來襲，演習旋即變成了真實的激烈對戰!小蘭與少年偵探團成員看到眼前的這一切，感到十分恐懼與不安。在海上自衛隊冷靜的應對處理下，戰況總算平息了下來，但是卻摸不清敵人的目的為何。在此同時，艦裏發現了一隻自衛隊員的左手殘肢，那隻手上戴了一隻時間停滯在上午5時30分的手錶……在如此不尋常的事態下，大阪府警方與京都府警方也緊急出動直升機前來現場，協力展...

以東京為中心發生六件大範圍的連續殺人事件，引起警政高層的重視，柯南意外地發現「黑色組織」涉及整個事件! 如果他們知道工藤新一還活着的話，那麼新一與柯南的夥伴們會不會一併遭到追殺?! 知道事態危險的柯南又如何獨自展開搜查.....

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雅典娜的哥哥，傳說中的太陽神福玻斯·亞伯（フォェボス アベル）復活，受眾神之命在地上世界引發大洪水來達到肅清人類的企圖。身為雅典娜的紗織打算阻止亞伯，反被亞伯殺死，靈魂墜入死之國度。為了拯救雅典娜，星矢等人潛入了聖域的禁地「Dignity Hill」，面前卻被在十二宮之戰中戰死的撒加等黃金聖鬥士以及從神話時代開始就守護亞伯的「日冕聖鬥士（Corona Saint）」所阻擋。面對以往從未遇到過的強敵，星矢等人最大的激戰展開...

「我想請你們幫我解決某起事件，但如果你們失敗的話……」 在神秘委託人的招待下，小五郎與柯南一行人來到了神奈川縣橫濱市。一行人受邀來到一座遊樂園，沒想到卻掉入神秘男子所設下的陷阱。小蘭、灰原與少年偵探團，也因此落入敵人手中成為人質。時間限制為12個小時，如果不在時間內解開男子所出的謎題，小蘭他們身上的炸彈就會爆炸。 「你能了解失去心愛的人，是什麼樣的心情嗎？工藤。」 這名男子居然知道柯南其實就是工藤新一？！這名男子的真正身份，難道是……就在同時，「關西的高中生偵探」服部平次的青梅竹馬遠山和葉...

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